Non metto in dubbio le tue impressioni ma a volte basta una piccola modifica per cambiar di molto la suonabilità dello strumento e quindi anche l'impressione che suoni meglio.
Se non hai toccato niente può semplicemente essere accaduto che, essendo inverno con temperature più basse e umidità maggiore, la chitarra si sia "trovata" con le giuste regolazioni per la stagione, mentre prima era regolata male (con il caldo i metalli si dilatano e il legno con l'umidità si gonfia).
Ultimamente mi è capitato di suonare con il truss rod troppo morbido (erano 2 anni che non lo regolavo) e non essermene mai accorto perché suonavo sempre di fuga tra una pausa e l'altra e avevo l'impressione che la chitarra non suonasse più bene. Poi domenica scorsa ho tirato di un giro il truss rod e.... sono rimasto incantato dalla differenza, sembra un altro strumento.
Penso però che questi cambiamenti così come li hai descritti tu possano incidere più che altro sulla suonabiltà, non sul timbro, e non credo che sia un cambiamento così repentino da accorgersene subito (o almeno a me non è mai capitato) e soprattutto non è un cambiamento tangibile su delle chitarre solid body. Sulle acustiche magari il discorso è diverso in quanto il legno ha un'influenza molto maggiore rispetto ad un'elettrica.
Poi considera che una chitarra del 2006 è ancora quasi nuova, differenze percepibili potrebbero sentirsi fra una decina di anni, ma dovresti metterle a confronto con il "suono" dello strumento di oggi.