Se dopo le regolazioni fatte dal fonico, già al soundcheck avevi un suono basdo e gracchiante dalle spie, forse soubdcheck e/o fonico non erano così buoni...
Per i pedali, mi pare che la confusione sia introdotta dal ' cosa boosta cosa', ovvero tante combinazioni.
Potresti seguire la via più semplice e destinare un singolo pedale ad ogni suono.
Se invece hai delle combo imprescindibili tipo klon+page partirei da quelle per regolare attorno il resto, ma in contesto live sono un po' scomode, ne userei un paio al massimo, alteimenti la via del looper midi mi sembra un buon consiglio.
Se poi il gruppo tende ad avere una dinamica che nell'impeto dei live ti può coprire allora un boost che non colora a fine catena ti può salvare sempre, magari con dopo il pedale del volume per regolarti al volo